Los indicios en contra del exmagistrado de la Corte de Constitucionalidad fueron presentados por la Fiscalía contra la Corrupción del Ministerio Público.
Las pesquisas establecen que Duarte no cesó en sus funciones de encargado del Despacho de la Subdirección de Asuntos Jurídicos del Congreso para ocupar la vacante del magistrado Alejandro Maldonado Aguirre.
En la audiencia de primera declaración la judicatura le concedió una medida sustitutiva de arresto domiciliario, la orden de acudir a la sede del Ministerio Público cada 15 días para firmar el libro de asistencia, tendrá arraigo y no puede acercarse a la Corte de Constitucionalidad ni al Congreso de la República.
Separado
En octubre de 2015, Duarte Barrera fue separado del cargo de magistrado titular de la Corte de Constitucionalidad (CC) de manera definitiva, en una decisión tomada por el pleno.
La votación fue 3 a 2. Los magistrados Gloria Porras, Mauro Chacón y María de los Ángeles Araujo estuvieron de acuerdo con la separación.