Mendizábal es sindicado de haber aprovechado su investidura para influir en otros magistrados para otorgarle un amparo a la ex vicepresidenta Roxana Baldetti a fin de revocarle la negativa que tenía para ser inscrita como secretaria general del Partito Patriota (PP).
La negativa a Baldetti fue dictaminada por el Tribunal Supremo Electoral el 25 de septiembre de 2014 en la que también se suspendía al PP por seis meses y se prohibía a los funcionarios públicos participar en actividades políticas electorales.
Según la investigación del Ministerio Público (MP) y la Comisión Internacional contra la Impunidad en Guatemala (Cicig), Mendizábal gestionó con otros magistrados favorecer a Roxana Baldetti y al PP, cuando estaba por dejar la corte y con grandes aspiraciones de dirigir la Procuraduría General de la Nación (PGN).
Los vínculos entre Mendizábal y Baldetti se determinaron a través de mensajes de Whatsapp, uno de ellos enviado el 7 de octubre de 2014, donde el exmagistrado le comentaba a Baldetti sobre la reunión de pleno de la CSJ que se celebraría antes de entregar el cargo, pero que estaba hecho el cabildeo para favorecerla con el amparo.
En la conversación supuestamente también Mendizábal le cuestionaba a Baldetti si el exdiputado Gudy Rivera había hablado con los otros magistrados para obtener los siete votos necesarios para ese fin. El exmagistrado también se puso a las órdenes de la ex vicepresidenta.
Al siguiente día, supuestamente el magistrado le volvió a escribir para confirmarle que la resolución del amparo había sido resuelta a su favor, también le contó que la CSJ lo había designado para presidir la Cámara Penal y le reiteró la disponibilidad de colaborarle en lo que ella requiriera.
En noviembre de 2014, cuando Mendizábal había dejado el cargo de magistrado, supuestamente le pidió directamente el apoyo a Baldetti para ser nombrado procurador General de la Nación, cuando el presidente Otto Pérez Molina debía hacer el nombramiento.
“Cuando mencionaba el fiscal que de una u otra manera yo influí en una decisión jurídica, no es así. Si uno se reúne con sus colegas, abogados, magistrados es para analizar y determinar si jurídicamente conviene o no otorgar o no otorgar un amparo”, dijo Mendizábal a la jueza.
