La DGAC fue intervenida en noviembre del 2009 (con el acuerdo 290-2009) sin un plazo previsto, sino el tiempo necesario a consideración del Organismo Ejecutivo con el fin de optimizar y mejorar la supervisión, vigilancia y regulación de la aviación civil.
Además se indica que la intervención en ese año también buscaba una transparente prestación de los servicios aeroportuarios y que respondan a las normas internacionales. Además de agilizar la expansión, construcción y equipamiento.
En el acuerdo se explica que se analizó la situación que dio lugar a la intervención y se evidencia que esta ya no se justifica “en vista de haberse logrado los fines paa los cuales fue emitida”.
En años recientes ha existido denuncias de contrataciones y compras dudosas durante varias administraciones.