Como eliminatorias más atractivas de estos cuartos de final destacan los duelos Mánchester United-Saint Etienne y Borussia Monchengladbach-Fiorentina.
Los partidos de ida tendrán lugar el 16 de febrero y los de vuelta el 23 del mismo mes.
Así quedaron las llaves:
- Athlétic Bilbao (ESP) – Apoel Nicosia (CYP)
- Legia Varsovia (POL) – Ajax Amsterdam (NED)
- Anderlecht (BEL) – Zenit Sant Petersburgo (RUS)
- Astra Giurgiu (ROM) – Genk (BEL)
- Manchester United (ENG) – Saint-Etienne (FRA)
- Villarreal (ESP) – AS Roma (ITA)
- Ludogorets (BUL) – Copenhague (DEN)
- Celta Vigo (ESP) – Shakhtar Donetsk (UKR)
- Olympiacos (GER) – Osmanlispor (TUR)
- La Gantoise (BEL) – Tottenham (ENG)
- Rostov (RUS) – Sparta Praga (CZE)
- Krasnodar (RUS) – Fenerbahçe (TUR)
- Borussia Mönchengladbach (GER) – Fiorentina (ITA)
- AZ Alkmaar (NED) – Lyon (FRA)
- H. Beer-Sheva (ISR) – Besiktas (TUR)
- PAOK Salónica (GRE) – Schalke (GER)