Shobukhova ha sido desposeída de sus victorias en el maratón de Chicago en los años 2009, 2010 y 2011, y en el de Londres en 2010, además de ser requerida para que devuelva el dinero recibido en premios.
La fondista rusa sólo se queda con su medalla de plata en los 5 mil metros de los Europeos de Gotemburgo 2006 y la del mismo metal conseguida en los 3 mil metros de los Mundiales en pista cubierta de Moscú, ese mismo año.
Shobukhova fue investigada por la IAAF sobre la base de anormalidades en su pasaporte biológico y el 9 de abril de 2014 fue hallada culpable de una infracción de las normativa antidopaje, por lo que fue suspendida por dos años por la Federación Rusa, pero la IAAF recurrió al Tribunal de Arbitraje Deportivo (TAS) solicitando una sanción mayor por circunstancias agravantes.
El TAS ratificó el acuerdo adoptado entre las partes (IAAF, Agencia Mundial Antidopaje, Agencia Rusa Antidopaje y la atleta) y le impuso a la fondista una suspensión de 3 años y 2 meses, entre el 24 de enero del 2013 y el 23 de marzo del 2016, además de anular todos sus resultados desde el 9 de octubre del 2009.
